罗伯特·科赫研究所虽然名为研究所，但其实为德国疾控机构，属于德国联邦卫生部，名称来源于德国微生物学家、细菌学鼻祖罗伯特·科赫。在此次新冠疫情中，德国保持远低于其他欧洲国家病亡率的成绩，与多方面因素相关，其中准备充分、反应较为迅速、决策科学依据充分、各方协调配合，这些都与罗伯特·科赫研究所的工作分不开。
总体上看，该机构在此次疫情中扮演着"总参谋长"的角色，主要工作包括制定指导文件；对数据进行汇总、分析并发布新闻；协调其牵头的全国7所传染病治疗中心；组织科学研究，以更加准确掌握疫情发展形势。
罗伯特·科赫研究所并没有下达行政命令的权力，主要通过发布指导意见为医疗机构和社会各界提供公共卫生建议和规范。
新冠疫情在中国暴发后，该机构1月份便公布了各项指导意见，例如新冠病例诊断、报告、转诊的病例定义，疑似病例管理指导意见，接触者管理指导意见，等等。德国卫生部长延斯·施潘在介绍德国抗疫经验时说道，早检测是德国在早期保持低病亡率的原因。这与罗伯特·科赫研究所很早公布病例定义分不开，有了详尽的病例定义，医生才能对患者进行有效分诊。
2月底新冠疫情在德国全面暴发后，罗伯特·科赫研究所每日在其官网上公布全国确诊病例数、死亡病例数等数据，这些数据由各联邦州卫生部上报。研究所对汇总数据进行分析后，形成每日的新冠疫情形势报告。从这份报告中人们可以直观地看到新冠患者、死亡者的人数、年龄、地域分布等。此外还有临床数据分析，例如各项主要症状在确诊患者中出现的比例、当前住院人数、当前基本传染数的估计、医护人员感染情况。这份报告还显示由德国重症监护和急诊医学跨学科协会领衔的重症床位数统计，包括当日已占用和剩余数，重症监护室死亡病例数、治愈病例数等。
罗伯特·科赫研究所发布的信息中一项重要内容是风险评估。此次疫情中该机构在不同时间节点就新冠病毒对德国人口健康风险做出评估。从疫情之初的低风险调整为"中等偏低风险"，3月2日从"中等偏低风险"调整至"中等风险"，3月17日从"中等风险"调整至"高风险"，3月26日进一步调整为"高风险，以及对脆弱人群风险很高"。
从疫情开始，罗伯特·科赫研究所定期召开新闻发布会，该所对于疫情严重程度的判断被媒体广泛报道，提供的基本传染数也成为解封的重要依据。
德国有一套既有架构应对突发疫情，这就是德国"严重传染疾病能力与治疗中心"常设工作组(STAKOB)，包括分散在全国7家大型医院的传染病治疗中心，以及8个主要市、州级卫生行政部门作为"能力中心"，由罗伯特·科赫研究所牵头。传染病病例首先在7家治疗中心收治。
平时，7家治疗中心会收到罗伯特·科赫研究所关于全球传染病的实时讯息，当有疫情发生时，这7家治疗中心会比其他医院更早获得关于新发传染病的预警。今年1月初，7家STAKOB治疗中心便接到罗伯特·科赫研究所关于新冠疫情的监测信息。研究所定期组织7家治疗中心开会，交流新冠确诊病例的诊疗信息，使尚没收治确诊病例的医院也能了解病例情况，共同探讨治疗方法。
新冠疫情期间，研究所还牵头组织了新冠抗体研究和相关手机应用的研发，旨在从不同渠道获取更多信息，更加准确判断德国疫情形势。
4月10日该机构宣布将与其他机构合作，在德国开展三项规模不一的新冠病毒抗体检测研究项目，以更加准确地评估新冠疫情的严重性，以及当前防控措施的有效性。
罗伯特·科赫研究所4月7日推出其参与开发的名为"新冠数据捐献"的应用软件，用户可将运动手环或智能手表监测到的健康数据上载到该软件，相关机构可通过这些数据评估疫情在德发展情况。据介绍，这一软件并不是以追踪接触者为目的，而是为研究者提供官方报告数据之外的另一数据源，有助于相关机构判断感染率、疫情扩散情况和防疫措施有效性。
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